Άγιος Νικόλαος, ο (στον Άγιο Νικόλαο) (εκκλησία)
Στη Φορτέτσα μαρτυρείται λατινική εκκλησία, αφιερωμένη στον Άγιο Νικόλαο, τον προστάτη αυτής της πολιτείας (“S. Nikolò, protetor di quella città”). Ο ναός αυτός- που βρισκόταν στην κεντρική μεγάλη πλατεία τού φρουρίου, όπου και το διοικητήριο και υψώνεται σήμερα το μεγάλο τζαμί- θεωρούνταν ως ο καθεδρικός/ μητροπολιτικός ναός (duomo) των Λατίνων τού Ρεθύμνου. Άρχισε να κτίζεται το 1583, μετά την καταστροφή τού προηγούμενου, κατά την οθωμανική εισβολή τού 1571, και χρησίμευε, κυρίως, για τις ανάγκες τού ιταλικού στρατεύματος και για κάποιες επίσημες τελετές (Κ. Λαμπρινός). Ο εν λόγω ναός, ουσιαστικά, δεν λειτούργησε ποτέ, γιατί οι Λατίνοι τού Ρεθύμνου δεν ανέβαιναν στη Φορτέτσα για να εκκλησιαστούν, ούτε δέχονταν να εγκαταλείψουν τις άνετες κατοικίες τους μέσα στην πόλη και να κατοικήσουν στον περιορισμένο χώρο τού φρουρίου. Έτσι, η εκκλησία τού αγίου Νικολάου δεν χρησιμοποιήθηκε ποτέ συστηματικά από τους Λατίνους τού Ρεθύμνου. Οι Λατίνοι τού Ρεθύμνου συνέχισαν, μέχρι τη τουρκική κατάκτηση, να λειτουργούν στην παλιά εκκλησία τής αγίας Αικατερίνης (S.ta Caterina), στο οικοδομικό τετράγωνο όπου και το τούρκικο χαμάμ, που αποτέλεσε την έδρα τού Λατίνου επισκόπου τού Ρεθύμνου.